文章目录

1材料与方法

1.1材料

1.2方法

    1.2.1番茄SlDCLs蛋白家族成员序列获得与进化树构建

    1.2.2生物信息学分析

    1.2.3番茄总RNA提取与DNA提取

    1.2.4顺势作用元件预测与可视化

    1.2.5 SlDCLs基因家族成员的表达分析

2 结果与分析

2.1 番茄DCLs蛋白的基本理化性质

2.2 染色体定位

2.3 DCLs蛋白结构域

2.4 系统发育进化树分析

2.5 启动子顺式作用元件分析

2.6 SlDCLs时空表达规律

2.7 不同逆境和激素下SlDCLs的表达分析

3 讨论与结论

文章摘要:Dicer-like蛋白（DCLs）是RNA沉默机制中的重要参与者,通过miRNA进行基因调控和植物的抗病毒保护,并且还与其他生物和非生物胁迫有关。研究番茄中DCLs的蛋白质基本功能以及SlDCLs对环境的响应,可以为DCLs参与抗逆途径及其在逆境中的作用提供理论依据。为深入了解番茄中RNase Ⅲ核酸内切酶Dicer-like蛋白基因家族的特征,利用生物信息学的方法对番茄DCL蛋白基因家族成员进行染色体定位,分析蛋白质基本理化性质、系统发育进化、启动子顺式作用元件、蛋白质结构域等。并通过qRT-PCR方法检测基因在组织中的表达模式和对激素、低温、盐、干旱等胁迫的响应。结果表明:番茄DCL基因有7个,分为4个家族;主要蛋白结构域有5个,启动子区域有响应各类激素、光信号、干旱等逆境的顺式作用元件,包括SlDCL1启动子区域的响应低温作用元件,SlDCL2a的SA、ABA响应元件,SlDCL2b的光响应元件,SlDCL2c的ABA,Me-JA响应元件,SlDCL2d的赤霉素响应元件,SlDCL3的Me-JA、SA响应元件,SlDCL4的干旱响应元件。结果表明:DCL家族基因在不同组织中具有不同的表达模式;激素、低温和渗透胁迫处理可以抑制或激活该家族成员的表达。SlDCL1直接响应低夜温,SlDCL2a对渗透胁迫响应明显;SlDCL2b的转录水平受到NACl的负调控;SlDCL2c受到低温以及ABA的正调控;SlDCL2d受NACl与PEG的负调控;PEG可以促进SlDCL3和SlDCL4的表达。

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