文章目录

1 材料与方法

1.1 植物材料与处理

1.2 茶树TCP家族CYC/TB1亚类基因成员鉴定

1.3 生物信息学分析

1.4 实时荧光定量表达分析

1.5 数据统计与分析

2 实验结果

2.1 茶树TCP家族CYC/TB1亚类基因成员鉴定

2.2 氨基酸序列比对分析

2.3 基因结构和保守基序分析

2.4 遗传进化分析

2.5 基因的表达分析

    2.5.1 茶树CYC/TB1基因在不同茶树树型、不同部位中的表达分析

    2.5.2 茶树CYC/TB1基因在缺氮条件下的表达分析

3 讨论

文章摘要:TCP （TEOSINTE BRANCHED 1/CYCLOIDEA/PROLIFERATING CELL FACTOR）是植物所特有的一类转录因子,广泛参与调控植物的生长发育。本研究从茶树基因组中获得茶树TCP家族CYC/TB1亚类分支的4个成员,分别命名为CsTCP1、CsTCP8、CsTCP12和CsTCP18。保守结构域分析发现,它们均包含典型的TCP结构域。亚细胞定位预测表明,其编码蛋白均定位于细胞核。系统进化分析可将CYC/TB1亚类分为四个分支（CYC1、CYC2、CYC3和TB1）,其中CsTCP1和CsTCP18同属于CYC1支, CsTCP8属于CYC2支, CsTCP12属于CYC3支。q RT-PCR分析发现,这四个基因在不同茶树树型不同部位中存在组织特异性表达:CsTCP1在成熟叶中表达量最高; CsTCP8主要在腋芽和嫩茎中表达; CsTCP12的表达量较低,在多个品种中未检出;而CsTCP18在6个茶树品种的各部位均有表达,但有一定差异,推测该亚族基因可能参与茶树的腋芽生长并调控茶树分枝。进一步对缺氮条件下这四个基因的表达量分析发现, CsTCP1在新梢中的表达量逐渐降低; CsTCP8的表达先升高后降低; CsTCP18的表达趋势与CsTCP8相反,表达量在缺氮12h时达到最高;而CsTCP12的表达量较低,在缺氮条件下未被检出,推测该亚族基因可能参与缺氮响应。

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